Выписка из егрн на землю: Выписка из ЕГРН на земельный участок

Кликните на карте на любой земельный участок или дом, чтобы получить информацию

Загрузка данных. ..

Пожалуйста, подождите.

Объект по этим данным не найден

На карте показываются только участки, для которых сделано межевание (т.е. измерены точные координаты углов).

Поэтому возможны 4 причины, по которым участка на карте нет

1. межевание не делалось вообще
2. межевание сделано давно (до 2006 года)
3. межевание сделано недавно (1-2 месяца назад)
4. технические ошибки кадастровой карты

Подробнее читайте в нашей статье

Объект по этому номеру не найден

Проверьте правильность кадастрового номера.

Он должен указываться с двоеточиями, и содержать 4 группы цифр. Например, 77:08:0009005:8

Или воспользуйтесь нашим расширенным поиском

Объект по этому номеру не найден

Проверьте правильность кадастрового номера.

Он должен указываться с двоеточиями, и содержать 4 группы цифр. Например, 77:08:0009005:8

Или воспользуйтесь нашим расширенным поиском

Объект по этому адресу не найден

Нужно указать более точный адрес.

Адреса бывают сложные, поэтому точнее найти объект по кадастровому номеру. Посмотрите его в документах. Например,

Или воспользуйтесь нашим расширенным поиском

Для сайтаДля форумаСсылка на координатыДинамическая картаСсылка на объектКарта ЯндексКарта GoogleКарта 2GISOpenStreetMapСпутник ЯндексСпутник GoogleСпутник Bingx4x5x6x7x8x9x10x11x12x13x14x15x16x17x18

Чтобы разместить карту на сайте или форуме, cкопируйте и вставьте код полностью и без изменений. А чтобы поделиться картой в социальных сетях — просто поставьте лайк:

Поэтому возможны 4 причины

1. межевание не делалось вообще
2. межевание сделано давно (до 2006 года)
3. межевание сделано недавно (1-2 месяца назад)
4. технические ошибки при регистрации межевого плана

Карта Без картыКарта ЯндексКарта GoogleКарта 2GISOpenStreetMapСпутник ЯндексСпутник GoogleСпутник Bing

Кадастровые границы Без кадастровых границС кадастровыми границами

Тематическая карта

Распечатать

8 вопросов об уточнении границ земельного участка

01.09.2020  Просмотров: 5276

Как и зачем уточнять границы земельного участка? Какие документы пригодятся при уточнении границ старого участка? Как провести согласование результатов в сложной эпидемиологической обстановке? На эти и другие вопросы ответили эксперты Федеральной кадастровой палаты.

1. Что такое граница участка?

Описание местоположения границ земельного участка является одним из основных сведений, позволяющих определить земельный участок в качестве индивидуально определенной вещи. Местоположение границ земельного участка отображается в графической части межевого плана. Кроме того, границы земельного участка могут быть установлены на местности. Местоположение границ земельного участка устанавливается путем определения координат характерных точек таких границ.

2. Что такое межевание?

Межевание – это комплекс инженерно-геодезических работ по установлению границ земельного участка на местности. Межевание проводит кадастровый инженер, который устанавливает местоположение границ земельного участка, определяет его площадь, проводит согласование местоположения границ смежных участков с соседями и подготавливает межевой план.

3. Зачем уточнять границы земельного участка?

Точно определенные границы земельного участка могут стать защитой от юридических проблем, которые могут возникнуть с землей. Например, от споров с соседями по границам земельного участка, а также самовольному строительству объектов недвижимости на таком земельном участке. Также наличие границ земельного участка дает возможность беспроблемно совершать с участком любые операции и сделки, например, продать его будет проще, ведь вряд ли покупатели захотят приобретать участок без четких границ.

Уточнение границ поможет исправить возможные ошибки, в том числе в сведениях о фактически используемой площади. Она может отличаться от той, что указана в сведениях ЕГРН. А ошибочные сведения о площади участка могут стать причиной неверного определения его кадастровой стоимости и, как следствие, неверного определения размера земельного налога.

Если вы решили разделить земельный участок, такой раздел возможен только при наличии установленных границ существующего земельного участка.

4. Как узнать, какие сведения о земельном участке внесены в Единый государственный реестр недвижимости?

Вся необходимая информация содержится в выписке из ЕГРН об основных характеристиках и зарегистрированных правах на объект недвижимости.

Если реестр не содержит необходимых сведений о границах, в выписке будет особая отметка: «Границы земельного участка не установлены в соответствии с требованиями земельного законодательства». Площадь такого участка будет указана целым числом – тем же, что и в правоустанавливающем документе.

В случае если содержащиеся в ЕГРН координаты характерных точек границ земельного участка определены с точностью не ниже нормативной точности определения координат для земель определенного целевого назначения, уточнение местоположения границ земельного участка не требуется, за исключением случая, если в сведениях ЕГРН о местоположении границ земельного участка содержится реестровая ошибка.

Можно воспользоваться и справочным сервисом «Публичная кадастровая карта». Найти конкретный земельный участок на ней проще всего по адресу. Если в окне описания объекта стоит отметка «Без координат границ» или площадь указана как декларированная, значит, требуется уточнение местоположения границ.

Важно! При обращении к кадастровой карте будьте внимательными: у сервиса есть сайты-двойники, которые могут представлять информацию, не соответствующую действительности. Публичная кадастровая карта размещена по адресу: pkk.rosreestr.ru.

Подать запрос в бумажном виде на получение выписки можно лично, обратившись в многофункциональный центр (МФЦ) или Кадастровую палату. Чтобы получить сведения ЕГРН дистанционно, можно воспользоваться сервисом Федеральной кадастровой палаты, который позволяет получить выписку в течение нескольких минут, либо официальным порталом Росреестра. Электронная выписка заверяется усиленной электронной подписью.

5. Как уточнить границы участка?

Уточнение местоположения границ – это целый комплекс работ, которые может провести только специалист, обладающий правом на осуществление кадастровой деятельности (кадастровый инженер). Поэтому в первую очередь собственнику необходимо обратиться к кадастровому инженеру для проведения необходимых работ. Ознакомиться с информацией о действующих кадастровых инженерах можно через сервис «Государственный реестр кадастровых инженеров». При выборе кадастрового инженера стоит обратить внимание на его опыт, качество и сроки выполнения кадастровых работ.

Кадастровый инженер выезжает на место и проводит необходимые замеры. Если есть забор, то замеры проводят по нему. Если забора нет, лучше заранее обозначить углы участка колышками. Следующий этап – ознакомление с результатами замеров. Далее – процесс согласования границ с владельцами смежных участков. После этого кадастровый инженер подает пакет документов в орган регистрации прав.

При формировании границы он должен соблюдать ряд правил: например, граница земельного участка не должна пересекать границы населенных пунктов или муниципальных образований; граница не должна пересекать границу смежных участков.

Результатом становится подготовка межевого плана, содержащего сведения о координатах границ земельного участка.

6. Какие нужны документы?

Кадастровый инженер не сможет установить границы земельного участка просто так, как хочется собственнику. Для проведения работ, в числе прочего, ему потребуются документальные свидетельства, что участок выделен именно в этом месте и именно такой площади.

Согласно действующему законодательству, уточнение границ земельного участка проводится на основании сведений, которые содержатся в правоустанавливающем документе на земельный участок.

Дополнительно могут быть использованы сведения, указанные в документах, определявших местоположение границ участка при его образовании.

Если таковых нет – уточнение можно провести в соответствии с границами, существующими на местности 15 и более лет и закрепленными с использованием природных объектов или объектов искусственного происхождения, позволяющих определить местоположение границ участка.

Дополнительные разъяснения даны Департаментом недвижимости Минэкономразвития. Документами, определяющими местоположение границ земельного участка при его образовании и их существование 15 и более лет, могут быть:

· Ситуационные планы, содержащиеся в техпаспортах объектов недвижимости (расположенных на земельном участке), которые подготовлены органами государственного технического учета и технической инвентаризации (БТИ).

· Материалы лесоустройства, планово-картографические материалы, имеющиеся в районных органах архитектуры, строительства и жилищного хозяйства, органах местной власти.

· Документы по территориальному планированию муниципальных образований.

· Проекты организации и застройки территории дачных, садовых и огородных некоммерческих товариществ.

Важно: документы должны соответствовать требованиям законодательства, действовавшего в месте издания документа и в момент издания.

7. Как согласовать границы участка с соседями?

Мало уточнить местоположение границ участка – необходимо согласовать его с правообладателями смежных, то есть соседских участков. Кадастровый инженер должен направить им соответствующие извещения на почтовый или электронный адрес. Если найти их не получается, кадастровый инженер публикует извещение в местной прессе. Адресат будет считаться уведомленным, даже если он не прочитает это объявление.

Правообладатели смежных участков должны подтвердить свое согласие, подписав акт согласования. В случае непреодолимых разногласий нужно подать кадастровому инженеру письменное возражение. Оно должно быть зафиксировано в акте согласования, а также приложено к межевому плану.

При наличии обоснованных возражений орган регистрации прав приостановит учетно-регистрационные действия, а решать разногласия соседям придется уже в суде. Кадастровый инженер, проводивший межевание, также может быть привлечен к делу в качестве третьего лица.

Урегулирование земельного спора на стадии согласования границ избавит от необходимости обращаться в суд. Судебные разбирательства по вопросам установления границ участков – одни из самых сложных и длительных.

8. Можно ли проводить согласование границ земельных участков в период сложной эпидемиологической обстановки?

Действующим законодательством не предусмотрено каких-либо особенностей процедуры согласования границ. Кадастровый инженер по своему выбору может проводить согласование как индивидуально с каждым соседом, так и проведя собрание с их участием. При этом если провести согласование в индивидуальном порядке по каким-то причинам невозможно, кадастровый инженер может в извещении о проведении собрания назначить определенное время для каждого заинтересованного лица.

Во время процедуры согласования в период сложной эпидемиологической обстановки необходимо соблюдать социальную дистанцию и пользоваться средствами индивидуальной защиты.

Органы прокуратуры разъясняют отдельные вопросы в отношении ранее учтенного земельного участка

Земельные участки считаются ранее учтенными в случаях, если их учет проведен до 01.03.2008 либо учет не был проведен, однако права на них зарегистрированы (и не прекращены) и им присвоены условные номера.

Внести сведения в Единый государственный реестр недвижимости (ЕГРН) о таком участке может потребоваться, например, для получения выписки из реестра и подтверждения существования земельного участка с определенными характеристиками (например, покупателю земельного участка).

Сведения о ранее учтенном земельном участке вносятся в ЕГРН на основании:

1) заявления правообладателя земельного участка о внесении сведений в ЕГРН о ранее учтенном земельном участке. К заявлению могут быть приложены документы, подтверждающие права на земельный участок.

В этом случае рекомендуется сначала проверить, действительно ли сведения в ЕГРН отсутствуют, поскольку орган регистрации прав мог внести их самостоятельно. Проверить такие сведения возможно на сайте Росреестра при помощи публичной кадастровой карты или сервиса «Справочная информация по объектам недвижимости в режиме онлайн».

Сведения о ранее учтенном земельном участке вносятся в ЕГРН бесплатно.

Законодательством предусмотрен закрытый перечень оснований для отказа во внесении в ЕГРН сведений о ранее учтенном земельном участке, в том числе если такие сведения уже содержатся в ЕГРН или представленный документ не соответствует тем требованиям законодательства, которые действовали в момент его издания;

2) запроса правообладателя земельного участка о предоставлении сведений из ЕГРН о земельном участке.

В этом случае правообладатель может запросить выписку об объекте недвижимости либо выписку об основных характеристиках и зарегистрированных правах на объект недвижимости.

Такой запрос может подать любое лицо и, если сведения в ЕГРН о ранее учтенном земельном участке отсутствуют, они будут внесены в ЕГРН самостоятельно регистрирующим органом.

3) межведомственного запроса.

Снятие же ранее учтенного земельного участка с кадастрового учета по инициативе его правообладателя невозможно. Орган регистрации прав делает это самостоятельно. Такой участок снимается с кадастрового учета только в том случае, если в ЕГРН нет сведений о его правообладателе.

Так, ранее учтенный земельный участок снимается с кадастрового учета, если:

1) правообладателю исходного земельного участка направлено уведомление о необходимости зарегистрировать право, однако в течение шести месяцев со дня его направления этого не сделано. В этом случае записи об участке в ЕГРН будет присвоен статус «архивная»;

2) не выявлены правообладатели исходного земельного участка либо объектов недвижимости (помещений в них), расположенных на ранее учтенном земельном участке либо его части. В этом случае орган регистрации прав должен направить в соответствующий орган государственной власти (орган местного самоуправления) запрос о наличии правоустанавливающих документов на ранее учтенный земельный участок и оснований для разграничения права собственности на землю. Земельный участок снимается с кадастрового учета в случае поступления ответа об их отсутствии либо непоступления ответа в течение трех месяцев со дня направления запроса.

На территории г. Новосибирской области органом регистрации прав является Управление Росреестра по Новосибирской области, в которое можно обращаться по рассматриваемым вопросам.

Материал предоставлен прокуратурой города Новосибирска

Выписки из ЕГРН – виды выписок, способы получения с 2017 года

С 2017 года Федеральная служба государственной регистрации, кадастра и картографии (Росреестр) изменила формы предоставления информации об объектах недвижимости.

Произошло это по требованиям федерального закона «О государственной регистрации недвижимости» (№ 218-ФЗ), выполнение положений которого сопровождалось объединением двух государственных структур, занимавшихся ранее учётом и регистрацией объектов в раздельном порядке:

1. Государственного Кадастра Недвижимости (ГКН)
2. Единого государственного реестра прав (ЕГРП)

В результате их слияния появилась новая государственная информационная служба – Единый государственный реестр недвижимости (ЕГРН), сконцентрировавший в единую базу:

• данные о недвижимости
• сведения о правах собственности на недвижимость

ЕГРН стал единственным достоверным источником систематизированной информации об объектах недвижимости на территории РФ. Часть сведений из ЕГРН была открыта для публичного доступа.

Объективная информация об объектах недвижимости, как и их кадастровый учёт, возникновение и переход права на объекты недвижимости отныне подтверждаются только соответствующими выписками из ЕГРН:

1. Выписка из ЕГРН об основных характеристиках и зарегистрированных правах на объект недвижимости
2. Выписка из ЕГРН о переходе прав на объект недвижимости
3. Выписка о правах отдельного лица на имевшиеся (имеющиеся) у него объекты недвижимости
4. Выписка о дате получения органом регистрации прав заявления о государственном кадастровом учете и (или) государственной регистрации прав и прилагаемых к нему документов

Состав выписок из ЕГРН, их содержание и формат установлены Приказом Минэкономразвития России (№ 378 от 20.06.2016 г. (Приложениями №№ 1 – 4).

Дополнительные сведения из ЕГРН предоставляются в виде следующих материалов:

• кадастровый план территории
• сведения о характеристиках объектов недвижимости:
  • площадь
  • назначение
  • кадастровый номер
  • кадастровая стоимость
• уведомление об отсутствии сведений о лицах, получивших сведения об объекте недвижимости
• справка о лицах, получивших сведения об объекте недвижимости
• уведомление об отсутствии в ЕГРН запрашиваемых сведений
• решение об отказе в предоставлении запрашиваемых сведений из ЕГРН
• сведения об ограничениях (обременениях) прав на недвижимое имущество
• сведения о сделках с объектами недвижимост,
• иные сведения, установленные законодательством

Судьба кадастрового паспорта на земельный участок и на любой объект недвижимости

Федеральный закон №218-ФЗ упразднил такой документ, как кадастровый паспорт объекта недвижимости, выдававшийся ранее после его кадастрового учёта и предназначавшийся для государственной регистрации права на этот объект.

Так как процедуры кадастрового учёта и госрегистрации права собственности объединены, то необходимость в кадастровом паспорте в виде отдельного документа исчезла (статья 28 ФЗ «О государственной регистрации недвижимости»).

Кадастровый паспорт сменил новый документ – Выписка из ЕГРН об основных характеристиках и зарегистрированных правах на объект недвижимости. подтверждающая госучёт объекта и его госрегистрацию.

Её форма и содержание установлены Приложением №1 к Приказу Минэкономразвития России № 378 от 20.06.2016 г..

Выписка из ЕГРН об основных характеристиках и зарегистрированных правах на объект недвижимости содержит общедоступные сведения:

• графические и текстовые данные
• информацию об основных характеристиках объекта
• данные о собственнике
• сведения об ограничениях и арестах

Выписка выдаётся для различных задач:

• для подтверждения государственного кадастрового учета (при постановке объекта на учёт или при снятии с учёта)
• для госрегистрации права на объект недвижимости
• для внесения в ЕГРН сведений о ранее учтённом объекте недвижимости

База ЕГРН не содержит сведения о не приватизированных объектах недвижимости, поэтому в Выписке на такую недвижимость будет указано, что «Запрашиваемые сведения отсутствуют».

Получить Выписку из ЕГРН об основных характеристиках и зарегистрированных правах на объект недвижимости можно в режиме on-line на ресурсе Росреестра или в МФЦ, подав запрос на предоставление Выписки из ЕГРН об основных характеристиках и зарегистрированных правах на объект недвижимости.

Выписка из ЕГРН о правах отдельного лица на имевшиеся (имеющиеся) у него объекты недвижимости

Сведения, которые содержатся в выписке о правах отдельного лица на объект недвижимости, являются информацией ограниченного доступа.

Они доступны только правообладателям или их представителям, а также государственным органам и прочим лицам, которые имеют право на получение информации из ЕГРН ограниченного доступа.

Форма и содержание этой Выписки установлены Приложением №3 к Приказу Минэкономразвития России № 378 от 20.06.2016 г.. (смотреть по тексту ниже Приложения №1).

Заказать Выписки из ЕГРН можно отправкой письма с уведомлением о получении при непосредственном обращении в офисы росреестра или Кадастровой палаты, через МФЦ, а в электронном виде — на официальном ресурсе Росреестра, воспользовавшись, к примеру этими ссылками:

При заказе выписки необходимо точно указать, какая именно выписка из ЕГРН необходима. От этого обстоятельства зависит корректность предоставляемой информации.

Выписка из ЕГРН о кадастровой стоимости объекта недвижимости заменила Справку о кадастровой стоимости

Справка о кадастровой стоимости земельного участка и любого другого объекта недвижимости с 1 января 2017 года, как и кадастровый паспорт, переместилась на иную позицию – «в прошлое».

Выписку из ЕГРН о кадастровой стоимости объекта недвижимости можно заказать отдельно. Сделать это можно на официальном сайте Росреестра. Предоставляется она бесплатно по запросам любых лиц.

Такая выписка потребуется для решения вопроса об изменении кадастрвой стоимости объекта, установленной государством.

Для чего необходимы Выписки и сведения из ЕГРН?

Выписки и сведения из ЕГРН могут потребоваться в различных ситуациях:

• при приобретении, аренде, наследовании имущества
• чтобы выяснить, кто является собственником объекта недвижимости
• для уточнения технических характеристик объекта недвижимости
• для согласования перепланировки помещений
• для объединения или разделения земель
• при обращении в суд для подтверждения факта регистрации собственности ответчика на имущество и для подачи ходатайства об обеспечительных мерах
• при выселении гражданина из квартиры в принудительном порядке
• при приватизации квартиры для подтверждения того, что право на приватизацию не было использовано ранее
• для постановки в очередь в качестве нуждающихся в улучшении жилищных условий
• для подтверждения того, что право на недвижимое имущество отсутствует
• многие иные ситуации

Польза от введения ЕГРН

• единый реестр (ЕГРН) максимально исключает мошеннические схемы
• доступность комплексной информации ЕГРН позволяет провести проверку права на объект, его границ по предъявлению паспорта
• выписка из ЕГРП и ЕГРН доступны в «одном окне» – нет необходимости обращения в несколько инстанций
• выписка из ЕГРН, помимо общих сведений о недвижимости и ее владельце, содержит информацию о документах, на основании которых возникло право собственности, а значит, позволяет установить правомерность совершения операции отчуждения недвижимости
• для тех, кто намерен зарегистрировать свое приобретение, возникает возможность не обращаться в несколько инстанций, каждая из которых может потребовать новых справок и документов — вся информация находится в едином реестре, и запрашивать её придется самим организациям
• ранее выданные документы (уже имеющихся на руках свидетельств о праве на недвижимость) сохраняют актуальность:
  • но для сделок потребуется выписка из ЕГРН

• С условиями оформления в собственность захваченной земли можно ознакомиться здесь
• Как используются и застраиваются участки в охранных зонах объектов культурного наследия, можно узнать здесь
• Узнать о новом Классификаторе ВРИ (2019) можно здесь
• Ознакомиться с тем, чем грозит ненадлежащее использование земельных участков, можно ознакомиться здесь
• Представление о градостроительном регламенте и его значении для застройки участков можнополучить здесь
• ФЗ «О ведении гражданами садоводства и огородничества», с особенностями которого можно ознакомиться здесь.
• С 1 января 2018 года должны быть зафиксированы точные границы участков, поскольку купить, продать, заложить или подарить землю без точного описания границ будет попросту невозможно. Так регламентировано поправками к Земельному кодексу. А тотальная ревизия границ по инициативе муниципалитетов началась с 1 июня 2015 г.
• Уточнить статус своей земли и границы можно на публичной кадастровой карте. Как получить необходимые сведения по имеющейся информации – по кадастровому номеру или адресу участка, помогут советы, представленные здесь
• Как провести раздел участка – подсказки здесь
• С расчётом налогов на недвижимость в 2017 году можно ознакомиться здесь
• Как рассчитать НДФЛ при продаже недвижимости, можно узнать здесь
• С порядком изменения ВРИ земельных участков, действующим с 2017 года можно ознакомиться здесь
• Как определить вид использования участка для ИЖС, ЛПХ, КФХ, дачного строительства по Классификатору ВРИ, можно ознакомиться здесь
• С 1 марта 2015 года вступил в силу новый Федеральный закон «О внесении изменений в Земельный кодекс РФ и отдельные законодательные акты РФ» (N 171-ФЗ от 23.06.2014 г.), в соответствии с которым, частности, упрощена процедура выкупа земельных участков у муниципалитетов. Ознакомиться с основными положениями закона можно здесь

Проверка участка с помощью выписки ЕГРН

Начиная с 2017 года, для того чтобы получить достоверные данные про конкретный земельный участок и его собственника достаточно сделать запрос на оформление выписки из ЕГРН. Этот документ сегодня полностью заменил выдаваемые ранее Росреестром справки и кадастровый паспорт.

Выписка из ЕГРН содержит полную информацию про земельный участок и может выдаваться после предоставления заинтересованным лицом соответствующего запроса.

Заявку на выписку можно оформить лично, обратившись в отделение Росреестра или в МФЦ. Также документ можно получить в электронном виде, отправив соответствующий запрос через наш сервис. Выписка из ЕГРН в электронном виде оформляется значительно быстрее и имеет такое же юридическое значение, как и бумажный вариант документа.

Причины получения справки на земельный участок

Выписка из ЕГРН на землю может понадобиться по разным причинам. Как правило, она оформляется для осуществления следующих операций с земельным участком:

• купля-продажа;
• аренда;
• найм;
• оформление залога;
• приватизация;
• разрешение спорных ситуаций в суде.

Данный документ необходим для проверки информации о земле и гарантии правомерности совершаемой сделки. Его могут запросить нотариус, будущий владелец или кредитная организация.

Форма заказа выписки из ЕГРН

Виды справок из ЕГРН

В зависимости от данных, содержащихся в документе выписка из ЕГРН бывает двух видов:

1. Стандартная справка с содержанием общедоступной информации.
2. Расширенная выписка с указанием координат.

В первом случае документ содержит информацию о земельном участке и о наличии на него обременений.

К общей информации об объекте относятся: адрес, площадь, кадастровая стоимость, государственный учетный и кадастровый номера, категория земельного участка, разрешенное предназначение земли, кадастровые номера расположенных на участке объектов.

Помимо вышеперечисленных данных выписка из ЕГРН содержит сведения о владельце земельного участка: ФИО владельца или название и ИНН фирмы, основание для регистрации прав и дата.

При наличии ограничений на объект (арест или ипотека) в документы указывается номер регистрации данного ограничения, срок его действия и основание для введения обременений на земельный участок. При наличии информации об изъятии объекта в пользу государства, государственной регистрации без разрешения третьей стороны её тоже указывают в справке.

В документе содержится информация о местоположении участка, его план и межевание.

Расширенная выписка содержит отметки координат и поворотных точек объекта.

Способы получения справки

Выписка из ЕГРН может быть оформлена в бумажном и в электронном варианте. Бумажный вид документа оформляется дольше и требует личного обращения заинтересованного лица. Оформление документа осуществляется после оплаты госпошлины, размер которой зависит от региона.

Чтобы получить справку в электронном виде достаточно заполнить и отправить соответствующий запрос через наш сервис. Электронная выписка из ЕГРН оформляется гораздо быстрее и отправляется на электронную почту заявителя. Такой вид справки подтверждается электронной подписью регистратора и имеет полный юридический статус.

Срок действия справки не зависит от способа ее предоставления, так как документ содержит только актуальную информацию на момент его выдачи. Законодательством не установлено конкретного срока действия для справки ЕГРН на земельный участок, но существует общее правило для всех организаций – справка действует в течение 30 дней.

Неочищенный экстракт и фракции листьев Eugenia uniflora Linn показали противовоспалительную, антиоксидантную и антибактериальную активность

BMC Complement Altern Med. 2018; 18: 84.

Tamires Rocha Falcão

¹ Кафедра биофизики и фармакологии, УФРН, Av.Senador Salgado Filho, S / N, Campus Universitário, Lagoa Nova, Natal, RN 59072-970 Бразилия

Aurigena Antunes de Araújo

¹ Департамент биофизики и фармакологии, UFRN, Av. Senador Salgado Filho, S / N, Campus Universitário, Lagoa Nova, Natal, RN 59072-970 Бразилия

Луис Альберто Лира Соарес

² Департамент фармацевтических наук, UFPE, Ресифи, PE Brazil

Rhayanne Thaís de Moraes

² Департамент фармацевтических наук, UFPE, Ресифи, PE Бразилия

Isabelle Cristinne Ferraz Bezerra

² Департамент фармацевтических наук, UFPE, Ресифи, PE Бразилия

Магда Райанни, Ассунсао, Феррейра

Manoel André de Souza Neto

³ Департамент фармацевтики, UFRN, Natal, RN Brazil

Maria Celeste Nunes Melo

⁴ UFRN, Natal, RN Brazil

Raimundo Fernandes de Araújo, Jr

⁵ Отделение морфологии, UFRN, Natal, RN Brazil

Andreza Conceição Véras de Aguiar Guerra

⁵ Отдел морфологии, UFRN, Натал, RN Brazil

Juliana Silva de Medeiros

¹ Отдел биофизики и фармакологии, UFRN, Av.Senador Salgado Filho, S / N, Campus Universitário, Lagoa Nova, Natal, RN 59072-970 Бразилия

⁵ Департамент морфологии, UFRN, Natal, RN Brazil

Gerlane Coelho Bernardo Guerra

В современных системах часто используются процессы, которые позволяют значительно повысить выход материала.Однако эти системы предъявляют особые требования к месту установки, например, часто требуют большого количества воды, что не позволяет экономично эксплуатировать их в засушливых и засушливых регионах. Обработка исходных материалов сложного состава, например, с содержанием молибдена, также не обязательно возможна с помощью этих методов. Из-за отсутствия адаптированных технологий обработки старые процессы обработки и, следовательно, более низкий выход материала все еще используются на некоторых объектах.

Проект ReWoRK направлен на устранение этого пробела в исследованиях и предоставление подходящих технологий для извлечения ранее неиспользованного содержания вольфрама.С этой целью партнерская сеть охватывает всю цепочку создания стоимости от разведки сырья (BGR) через рудники (MTS) и исследовательские объекты (CUTEC, UFRN, EEMA) до производства и переработки продукции (HST). В проекте участвуют бразильские и немецкие партнеры.

Разработка процессов

Целью проекта является, прежде всего, восполнить пробел в технологических исследованиях обработки отвального материала. На первом этапе будут исследованы свалки в Европе и Бразилии и взяты обширные пробы.Дальнейшими шагами являются разработка процесса в лаборатории, производство концентратов вольфрамовой руды с положительным прогнозом рентабельности, а также строительство функциональной демонстрационной установки.

Внедрение в нескольких местах

Результаты проекта будут реализованы в Бразилии (Currais Novos), а также в других возможных местах. Для этого непосредственно на площадках рудника будут установлены технологии переработки концентрата вольфрамовой руды.В Бразилии по результатам проекта также запланирована модернизация используемых до сих пор технологий. В Германии, с другой стороны, при необходимости планируются корректировки для обработки полученных концентратов. В долгосрочной перспективе разработанные технологии переработки могут также способствовать повышению эффективности будущих вольфрамовых рудников на других объектах.

Повышение ресурсоэффективности

Используя вторичные материалы и увеличивая выход при первичной добыче, можно повысить эффективность использования ресурсов, тем самым сохраняя природные ресурсы. Из-за разрушения свалок, если дополнительные побочные продукты извлекаются во время переработки, высвобожденные участки могут быть возвращены для другого использования или восстановлены. Если в отвале будут находиться другие и, возможно, критические тяжелые металлы, их можно также удалить из материала, что предотвратит загрязнение окружающей среды в будущем.При использовании хвостов для добычи вольфрама следует ожидать дальнейшего значительного снижения воздействия на окружающую среду, поскольку материал извлекается и, следовательно, легко доступен, что делает ненужной сложную добычу. Но снижение воздействия на окружающую среду также следует ожидать за счет повышения эффективности первичной добычи.

Со стратегической точки зрения надежность снабжения Германии может быть повышена за счет расширения доступных технологий и исходных материалов для производства вольфрама.

Cherry B Complex Energy & Immunity Support

Свекла

Свекла — это основная часть растения свеклы. Это один из нескольких культурных сортов Beta vulgaris , выращиваемых для получения съедобных стержневых корней и листьев (называемых свекольной зеленью). Темно-красный цвет свеклы является результатом присутствия определенного типа пигмента беталаина (бетацианинов). Свекла также содержит бетаин и неорганические нитраты.

Беталаиновые пигменты

Глубокий красный цвет свеклы обусловлен присутствием пигментов беталаина.Есть две категории бетацианов, одна из которых отвечает за эти красноватые или фиолетовые цвета — бетацианины. Бетанин — это пример бетацианинов, присутствующих в красной свекле.

Бетаин (триметилглицин (TMG))

Бетаин — это встречающееся в природе вещество и аминокислота, содержащаяся в растениях и особенно в свекле. Бетаин создается холином в сочетании с аминокислотой глицином.

Пищевая селитра

Нитрат — это неорганическое соединение, состоящее из азота и кислорода, которое естественным образом содержится в почве и воде.Нитраты в нашем рационе поступают как из пищи, так и из питьевой воды, но самый высокий уровень диетических нитратов содержится в овощах.

Вишня Монморанси

Вишня монморанси — разновидность красной, кислой вишни — Prunus cerasus . Они выращиваются в Канаде, Франции и США и являются частью светло-красного сорта вишни Amarelle , а не темно-красного сорта Morello .

Витамин B6

Витамин B6 способствует нормальному функционированию иммунной системы, регуляции гормональной активности, нормальному синтезу цистеина, нормальному энергетическому метаболизму, нормальному метаболизму гомоцистеина, нормальному метаболизму белков и гликогена и снижению усталости и утомляемости. Нажмите здесь и здесь, чтобы получить научные заключения EFSA.

Куркума и куркумин

Куркума — корневищное травянистое многолетнее растение ( Curcuma longa ) из семейства имбирных Zingiberaceae.Родом из южной Азии.

Если корневища (корни) не используются в свежем виде, их кипятят в течение 30-45 минут, а затем сушат в горячих печах, после чего их измельчают в темно-оранжевый / желтый порошок, который обычно используется в Бангладеш в качестве натурального красителя и вкусной специи. , Индийской, иранской и пакистанской кухни, а также для окрашивания.

Порошок корня куркумы давно используется практикующими аюрведами, в основном из-за его основного компонента — куркумина.В последнее время он становится все более популярным в западном мире для использования как в пищевых продуктах, так и в пищевых добавках после большого количества сообщений на телевидении, в журналах и на радио.

Черный перец

Черный перец ( Piper nigrum ) — это цветущая виноградная лоза из семейства Piperaceae , выращиваемая для получения плодов, которые обычно сушат и используют в качестве приправы и приправы. В сушеном виде плод известен как перец горошком. В свежем и полностью созревшем виде он составляет примерно 5 миллиметров (0.20 дюймов) в диаметре, темно-красного цвета и, как и все костянки, содержит одно семя.

Перец и полученный из него молотый перец можно описать просто как перец или, точнее, как черный перец (приготовленные и сушеные незрелые плоды), зеленый перец (сушеные незрелые плоды) и белый перец (семена спелых плодов). Пиперин — это алкалоид, отвечающий за остроту черного перца.

границ | Бактерии ризоплана и виды растений совместно определяют опосредованный фосфором эффект микробного наследия

Введение

Фосфор (P) необходим для роста и развития растений (Raghothama, 1999; Vance et al., 2003), и часто является ограничивающим питательным веществом в сельскохозяйственных почвах по всему миру (Sattari et al., 2012). Однако большая часть фосфора, вносимого в агроэкосистемы в виде минеральных удобрений, навоза и отходов, сохраняется в почве в виде неорганического и органического фосфора, который редко доступен для растений из-за высокой сорбционной способности большинства почв. низкая эффективность поглощения и использования фосфора большинством сельскохозяйственных культур (Condron et al., 2013). Следовательно, значительная часть внесенного фосфора накапливается в почве в виде остаточного фосфора.Этого запаса унаследованного фосфора в сельскохозяйственных почвах может хватить для поддержания урожайности сельскохозяйственных культур в мире в течение примерно 100 лет без снижения урожайности, если он будет доступен (Zhu et al., 2018). Много усилий направлено на повышение доступности этого унаследованного P для сельскохозяйственных культур (Menezes-Blackburn et al., 2018). Почвенные микроорганизмы, в частности микробиота корней и ризосферы, привлекают большое внимание, поскольку эти микробиомы играют ключевую роль в определении здоровья и продуктивности растений (Berendsen et al., 2012).

Многие почвенные бактерии и грибы обладают значительным потенциалом повышения биодоступности и использования остаточных источников фосфора. Исследования были посвящены влиянию удобрения P на разнообразие и состав почвенных микробных сообществ, а также пониманию механизмов, с помощью которых микробы добывают или поглощают почвенный P (Richardson and Simpson, 2011). Фосфорное удобрение значительно увеличило разнообразие и изобилие генов, участвующих в цикле P (Su et al., 2015).Микробы, участвующие в цикле P, выделяют фосфатазы (Tabatabai, 1994), чтобы мобилизовать ортофосфат. Некоторые микробы содержат гены, индуцируемые фосфатным голоданием (psi), и действуют как часть регулона фосфатного голодания. Эти микробы обладают способностью синтезировать фосфомоноэстеразы и фосфодиэстеразы (Вершинина, Знаменская, 2002). Oxalobacteraceae (в основном Massilia и Herbaspirillum ), Klebsiella и некоторые виды Burkholderia и Bacillus были обогащены почвой с фосфатно-модифицированной почвой по сравнению с почвой, трижды обработанной суперфосфатом.

Происходит переход от основной массы почвы через ризосферу к ризоплану, при этом ризоплан действует как регулирующие ворота для проникновения микробов в хозяина (Van der Heijden and Schlaeppi, 2015). Сообщалось о четкой иерархической фильтрации микробиоты соей и люцерной в различных ризокомпартментах, например, клубеньковых и корневых эндофитах, ризосфере и корневой зоне (Xiao et al., 2017). Напротив, бактериальные сообщества в клубеньках и корнях Lotus japonicus имели параллельный, но не последовательный характер (Zgadzaj et al., 2016). В настоящее время у нас нет прогностической основы для понимания биотических и абиотических факторов, определяющих наблюдаемые различия в микробиоме ризосферы. Как фильтрация окружающей среды, так и характеристики растений могут совместно определять дифференциацию корневой микробиоты. Недавнее исследование показало, что структура сообщества корневого микробиома координируется благодаря взаимодействиям между голоданием растений P и иммунными реакциями растений (Castrillo et al., 2017). Следовательно, понимание того, насколько и как различия в микробиомах корней и ризосферы реагируют на градиенты P-стресса, имеет решающее значение для расшифровки природы растительно-микробных взаимодействий в ответ на поступление P.

Микробиомы корней эволюционируют вместе с растениями. Микробиота корней постоянно влияет на рост и здоровье растений (Richardson and Simpson, 2011; Dombrowski et al., 2017; Hartman et al., 2017). Как в агро-, так и в естественных экосистемах предыдущее растение часто оставляет наследство для последующего роста (Van der Putten et al., 2013). Отрицательная обратная связь между растениями и почвой (PSF) часто наблюдается в непрерывной монокультуре, вызванной накоплением определенных патогенов. Отрицательная обратная связь может быть устранена или преобразована в положительную PSF при чередовании растений с другими культурами (Ocimati et al., 2017). Одновременно в условиях дефицита питательных веществ растения могут предпочтительно выбирать корневую микробиоту, чтобы способствовать усвоению питательных веществ хозяином, что также приводит к положительному PSF (Revillini et al., 2016). При достаточном снабжении питательными веществами Р-солюбилизирующие бактерии уменьшались в ризосфере (Mander et al., 2012). Зависимые от культуры исследования взаимодействия между поставкой фосфора и микробами показали, что минерализация фосфатов была выше в почве с низким содержанием фосфора, чем в почве с высоким содержанием фосфора (Mander et al., 2012). Эти результаты предполагают, что долгосрочные поправки на питательные вещества могут отбирать микробы, которые по-разному влияют на приспособленность микробов и растения-хозяина.Нам необходимо понять, изменились ли микробные сообщества, связанные с культурами, в результате удобрения P, и не ослабляются ли потенциальные полезные взаимодействия между растениями и связанными с ними микробами со временем из-за диверсификации микробной ниши.

В этом исследовании нас интересовало, влияло ли и в какой степени P-опосредованное удобрение микробное наследие на последующее кон- или гетероспецифичное поглощение P растениями. Кукуруза выращивается в монокультуре в течение 10 лет, и мы выбрали кукурузу и клевер в качестве растений-хозяев, поскольку образующие клубеньки бобовые имеют тенденцию вести себя иначе, чем виды злаков из-за их симбиотических взаимоотношений с различными бактериями и высокой потребности в фосфоре для фиксации азота со стороны растений. Атмосфера.Планы посевов обычно основаны на взаимодополняемости функциональных признаков наземных растений при игнорировании взаимодействий между растениями и микробами. Интеграция микробной динамики в системы земледелия в конечном итоге поможет прямо или косвенно манипулировать микробными сообществами для повышения эффективности использования фосфора и поддержания урожайности сельскохозяйственных культур.

Мы выдвинули гипотезу, что: (1) по сравнению с почвенным наследием P, различные виды растений оказывают более сильное влияние на выбор микробных сообществ в ризоплане и ризосфере; (2) микробиота ризосферы потенциально больше связана с мобилизацией фосфора при низком уровне фосфора или более связана с углеродным метаболизмом при более высоком содержании фосфора; и (3) микробные сети в ризоплане характеризуются более функционально взаимосвязанными операционными таксономическими единицами (OTU), чем таковые в ризосфере и основной массе почвы.Сетевой анализ использовался для изучения организации и динамики микробных ниш (Duran-Pinedo et al., 2011; Faust and Raes, 2012).

Материалы и методы

Место отбора проб и подготовка почвы

В этом исследовании использовалась почва, полученная в результате длительного испытания удобрения P на экспериментальной станции Шанчжуан Китайского сельскохозяйственного университета в Пекине (39 ° 59′N, 116 ° 17′E). Климат теплый и полувлажный со средней годовой температурой 13,2 ° C и количеством осадков от 213 до 840 мм.Тип почвы — известняковая аллювиальная почва с типичным для региона илистым суглинком. Испытание было начато в 2007 году и состояло из градиента внесения фосфорных удобрений с ежегодным внесением 0, 11, 22, 33, 44, 66 и 131 кг P га ^–1 в виде суперфосфата кальция. Семена яровой кукурузы (сорт Zheng dan 958; выращивается как монокультура) ежегодно высевали в мае.

Пробы почвы (инокулят) были отобраны с делянок. Здесь мы использовали I ₀ (ноль P), I ₃₃ (33 кг P га ^–1 ) и I ₁₃₁ (131 кг P га ^–1 ).Всего было собрано 12 почвенных посевов (3 уровня удобрения × 4 повтора). Почвенный субстрат, используемый для эксперимента, собирали с верхних 20 см того же эксперимента, но с участков без кукурузы. Почву сушили на воздухе, просеивали (2 мм) и стерилизовали гамма-излучением (> 25 кГрей, Пекинский исследовательский центр по применению радиации). Физико-химические свойства почвы: содержание органического углерода 11,5 г кг ^–1 , общий N 0,72 г кг ^–1 , доступный N 8,5 мг кг ^–1 (NO ₃ ^– и NH ₄ ⁺ ), Ольсен-П 3.5 мг кг ^–1 , NH ₄ OAc-K 32,3 мг кг ^–1 и pH 8,2 (1: 5, от почвы к воде). Минеральные питательные вещества были тщательно смешаны с почвой в следующих концентрациях (^–1 мг сухой почвы): 100 N в виде NH ₄ NO ₃ , 5 и 30 P (P ₅ и P ₃₀ ) как KH ₂ PO ₄ и 100 K как K ₂ SO ₄ . Добавленные питательные вещества тщательно перемешали с почвой.

Экспериментальный проект

Эксперимент с горшком проводился в теплице Китайского сельскохозяйственного университета.Был использован четырехфакторный эксперимент с кукурузой и клевером, тремя почвенными инокулятами (I ₀ , I ₃₃ и I ₁₃₁ ), цельной почвой или стерилизованной, и двумя уровнями P (P ₅ и Р ₃₀ ). Каждую обработку проводили в четырех повторах, что дало 96 горшков. Блок-схема основных экспериментальных установок показана на рисунке 1.

Рисунок 1. Блок-схема эксперимента.

Сбор урожая и отбор проб

Кукуруза была собрана через 65 дней.Клевер собирали дважды: через 105 дней на P ₅ и через 85 дней на P ₃₀ . В обработке P ₅ рост клевера был очень медленным, и только через 105 дней они были в том же онтогенезе, что и в P ₃₀ .

Убирали отдельно побеги и корни кукурузы и клевера. Образцы побегов нагревали при 105 ° C в течение 30 минут, а затем сушили в печи (72 часа, 75 ° C), взвешивали и измельчали ​​для анализа питательных веществ. Концентрацию фосфора в растении определяли молибдо-ванадофосфатным методом после того, как образцы переваривали концентрированным H ₂ SO ₄ и H ₂ O ₂ .

Грунты, слабо прикрепленные к корням растений, удаляли легким встряхиванием, что считалось сыпучим грунтом. Почвы, тесно связанные с корнями растений, отделяли с помощью интенсивного вихря (Mobio, 13111-v-220, США) с 50 мл стерильного физиологического раствора с фосфатным буфером (PBS). Корни интенсивно перемешивали стерильными щипцами, чтобы удалить всю почву с поверхности корня. Мы центрифугировали (Sigma-Aldrich, sigma3k15, Германия) этот раствор и считали осадок ризосферной почвой.После удаления всех почв корни помещали в пробирку с 15 мл PBS. Корни в пробирке обрабатывали ультразвуком в течение 30 с при частоте 50–60 Гц (выходная частота 42 кГц, мощность 90 Вт, ультразвуковая очистка, Branson Ultrasonics, США). Корни были удалены и отброшены, и мы центрифугировали раствор. Эта часть отложений считалась почвой ризоплана. Эффективность этой процедуры для удаления микробов с ризопланы на целых корнях, не обработанных ультразвуком, и корнях, обработанных трижды ультразвуком, была показана с помощью сканирующей электронной микроскопии (SEM; дополнительный рисунок S1).

Экстракция ДНК, амплификация гена 16S рРНК и секвенирование MiSeq

Мы экстрагировали общую ДНК из трех отобранных ризокомпартментов (ризоплана, ризосфера и насыпные почвы) с помощью набора для быстрого спина ДНК ^® (MP Biomedicals, Кливленд, Огайо, США) в соответствии с инструкциями производителя. Мы не исследовали эндосферу, так как ризоплан является сильным фильтром для микробных сообществ. Количество и качество образцов ДНК определяли с использованием спектрофотометра УФ-видимого света NanoDrop ND-1000 (NanoDrop Technologies, Уилмингтон, Делавэр, США).После экстракции ДНК образцы хранили при -20 ° C для высокопроизводительного анализа секвенирования.

ДНК почвы амплифицировали и закодировали с помощью набора праймеров 338F и 806R. Праймеры 338F (5′-ACTCCTACGGGAGGC AGCAG-3 ‘) и 806R (5′-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3’) нацелены на гипервариабельные области V4 – V5 бактериального гена рибосомной РНК 16S. Каждая уникальная последовательность штрих-кода была добавлена ​​к прямому праймеру в каждом образце. ПЦР проводили с 10 нг матричной ДНК, 0,8 мкл каждого праймера, оба по 5 мкМ, 4 мкл 5 × буфера FastPfu, 2 мкл 2.5 мМ dNTP, 0,4 мкл полимеразы FastPfu (TransGen Biotech, Пекин, Китай), доведенный до конечного объема 20 мкл с помощью ddH ₂ O, и температурные условия были 95 ° C в течение 3 минут, 27 циклов по 95 ° C в течение 30 секунд, 55 ° C в течение 30 секунд и 72 ° C в течение 45 секунд расширения, затем 72 ° C в течение 10 минут. Затем продукты ПЦР очищали и смешивали в эквимолярных соотношениях для получения количественной библиотеки образцов ДНК, которую в дальнейшем использовали для секвенирования с адаптера. Наконец, секвенирование было проведено с использованием платформы Illumina MiSeq, и последовательности были отправлены в базу данных NCBI под номером доступа SUB3124089.Необработанные последовательности были демультиплексированы и отфильтрованы по качеству с использованием набора инструментов Quantitative Insights Into Microbial Ecology (QIIME) (версия 1.19). Праймеры удаляли, а последовательности с показателем качества <20 или любые усеченные считывания короче 50 п.н. удаляли. Затем OTU были сгруппированы на уровне сходства последовательностей 97% с использованием программы Usearch, которая обеспечивает кластеризацию, проверку химер и качественную фильтрацию в QIIME. Наконец, наиболее распространенная последовательность для каждой OTU была выбрана в качестве репрезентативной OTU, и таксономические аннотации были присвоены репрезентативной последовательности каждой OTU в базе данных 16S рРНК SILVA (SSU117 / 119) для бактерий (Yilmaz et al., 2014).

Функциональное прогнозирование сообществ почвенных бактерий

Чтобы лучше понять потенциальный функциональный вклад наблюдаемых сдвигов в микробном составе в ризоплане (ризоплан действует как критические ворота для контроля проникновения микробов в ткань хозяина), мы назначили функциональные профили для двух обработок P (P ₃₀ и P ₅ ) с использованием программного пакета PICRUSt (Langille et al., 2013). Этот метод оценивает количество геномных копий каждого семейства генов (KO) в OTU из образца окружающей среды на основе положения этих OTU в эталонной филогении полных микробных геномов.Назначения функциональных профилей были сделаны на основе частичных последовательностей гена 16S рРНК, и последовательности были картированы в эталонную филогению Greengenes 13_8 с использованием QIIME (Morrow et al., 2015). После функционального назначения полученные профили распространенности семейств генов в образцах были обобщены в KEGG Pathways с помощью PICRUSt. Таблица, содержащая распространенность функциональных генов для каждого образца в таблице численности KO и уровне подсистемы 3 ортологов KEGG, была загружена для анализа.

Сетевой анализ

OTU с относительно высокой численностью (> 300 последовательностей на OUT, всего 1781 OTU) были оставлены для сетевого анализа.SparCCs (разреженные корреляции для композиционных данных) были сконструированы для вывода бактериальных сетей взаимодействия OTU – OTU, как описано Faust et al. (2012), Hu et al. (2019) и Perez-Jaramillo et al. (2019). Как правило, значимость SparCC оценивалась с помощью теста перестановки с 999 перестановками случайных выборок в матрицах присутствия / отсутствия. SparCCs выше 0,5 или ниже -0,5 и статистическая значимость ( P <0,01) были извлечены и импортированы в сетевой анализ (Faust et al., 2012; Hu et al., 2019). Топология сетей рассчитывалась с помощью платформы Gephi. Визуализация сети совместного возникновения также была достигнута с помощью платформы Gephi (Bastian et al., 2009).

Статистический анализ

Существенные различия в концентрации фосфора и содержании кукурузы и клевера между различными инокулятами с разными уровнями фосфора и стерилизационной обработкой были проанализированы с использованием трехфакторного дисперсионного анализа с последующим анализом множественного сравнения Дункана с использованием SPSS 20.0 (SPSS, Inc., Чикаго, Иллинойс, США).

OTU с низким содержанием удалялись, если у них не было в общей сложности не менее пяти считываний для всех образцов. Оценки α-разнообразия были основаны на матрицах обилия OTU и включали число OTU и разнообразие Шеннона-Винера, рассчитанное с помощью функционального разнообразия в пакете R Vegan (Hammer et al., 2001). Бактериальное β-разнообразие исследовали с помощью анализа сходства (ANOSIM) и пермутационного многомерного дисперсионного анализа (PERMANOVA) с использованием пакета R vegan (версия 3.3.1) с 999 перестановками (Андерсон, 2001). Анализ главных координат (PCoA) использовался для сравнения β-разнообразия между образцами на основе расстояния Брея-Кертиса. Это было выполнено в программном пакете R (версия 3.3.1) с использованием библиотеки «ape» (Paradis et al., 2004). ПЕРМАНОВА дисперсии β-разнообразия была проведена на основе расстояния Брея – Кертиса. Тернарные графики были нарисованы в R с использованием пакета vcd (Meyer et al., 2015). Был проведен ограниченный анализ главных координат (CAP), чтобы проверить величину дисперсии, объясняемую уровнем P и инокулятом в каждом ризокомпартменте двух видов растений, с функцией capscale пакета R (Oksanen et al., 2013). Чтобы оценить реакцию прогнозируемых профилей микробных функций на поступление субстрата P, мы реорганизовали данные, чтобы суммировать численность каждой прогнозируемой функции при обработке P ₅ и P ₃₀ отдельно. Программный пакет анализа метагеномных профилей (STAMP) был использован (Parks and Beiko, 2010) для сравнения предсказанных функциональных профилей различных субстратов P, поставляемых для каждого вида растений. P -значения были рассчитаны с использованием двустороннего точного критерия Фишера, в то время как доверительные интервалы были рассчитаны с использованием метода Ньюкомба – Уилсона, а поправка была сделана с использованием коэффициента ложных открытий Бенджамини – Хохберга (Benjamini and Hochberg, 1995).

Результаты

Выстрел P Content

Доступные концентрации фосфора как в кукурузе, так и в клевере были значительно выше при P ₃₀ , чем при P ₅ . Не наблюдалось значительных различий в доступном P между различными обработками инокулята, за исключением того, что доступный P в кукурузе при P ₅ при инокулировании I ₁₃₁ был значительно выше, чем при инокулировании I ₀ и I ₃₃ (дополнительная таблица S1). Не наблюдалось значительных различий в концентрации P в побегах кукурузы и клевера между разными инокулятами и между обоими уровнями P (за исключением I ₁₃₁ ).В целом, живой инокулят значительно увеличивал содержание P в побегах как кукурузы, так и клевера, за исключением того, что значительный положительный эффект уменьшался при P ₃₀ для кукурузы. На обоих уровнях P содержание фосфора в побегах кукурузы при обработке I ₁₃₁ было значительно выше, чем при обработке I ₀ и I ₃₃ (дополнительная таблица S1).

Бактериальное альфа-разнообразие и структура сообщества (бета-разнообразие)

После контроля качества было получено в общей сложности 6 180 927 высококачественных последовательностей со средним числом считываний на образец 37 234 (диапазон: 25 345–44 934) при средней длине считывания 437 п.н.Высококачественные считывания были сгруппированы в 7 132 микробных OTU с использованием ≥97% идентичности последовательностей. Только 30 OTU с низкой численностью (всего <5 считываний) были отброшены, что дало 7102 OTU для окончательного анализа.

Было отмечено сильное влияние компартмента на бактериальное α-разнообразие в ризосфере как кукурузы, так и клевера ( P <0,001). Числа OTU и индексы Шеннона-Винера выявили аналогичный градиент разнообразия от ризопланы к массивной почве (рис. 2A, B), с ризопланой <ризосфера ≈ насыпной почвой в кукурузе и значительным увеличением разнообразия в порядке ризоплана <ризосфера <основная масса почва в растении клевера (Рисунки 2A, B).

Рис. 2. Коробчатая диаграмма альфа-разнообразия бактериального сообщества в различных ризокомпартментах (ризоплан, ризосфера, объемная почва) растений кукурузы и клевера. (А) номер ОТУ; (B) Индекс Шеннона – Вайнера.

Анализ основных координат всех выборок, основанный на различиях Брея-Кертиса, показал, что первые две оси объясняют 45,4% дисперсии, причем первая ось (объясненная дисперсия 26,0%) разделяет образцы по отсекам, а вторая ось (19.4%) по видам растений. И у кукурузы, и у клевера наблюдалась четкая дифференциация между различными ризокомпартментами (рис. 3), и это было дополнительно подтверждено анализом PERMANOVA, основанным на метрике расстояния Брея – Кертиса (кукуруза: R ² = 0,440, P <0,001; клевер: R ² = 0,306, P <0,001) (дополнительная таблица S2). По сравнению с корневищем, уровень подачи субстрата P (кукуруза: R ² = 0,021, P = 0.009; клевер: R ² = 0,025, P = 0,007) и инокулят (кукуруза: R ² = 0,031, P = 0,010; клевер: R ² = 0,027, P = 0,077) оказали гораздо более слабое влияние на бактериальные сообщества (рисунок 3 и дополнительная таблица S2). Структура бактериального сообщества в различных ризокомпартментах, на которую влияет уровень P, показала, что снабжение P в пополнении микробиоты ризосферы было сильнее для клевера, чем для кукурузы (Рисунок 4 и дополнительная таблица S3).Далее был проведен ограниченный анализ главных координат (CAP) на расстоянии Брея – Кертиса для количественной оценки дисперсии, относящейся к каждой экспериментальной переменной. При кондиционировании в ризокомпартменте бактериальные сообщества значительно различались между P ₅ и P ₃₀ (дополнительная таблица S4), и разница была более отчетливой для клевера, чем для кукурузы. Более того, бактериальные сообщества, основанные на метрике расстояния Брея-Кертиса между обработкой исходным и стерилизованным инокулятом, значительно различались (кукуруза: R ² = 0.212, P = 0,001; клевер: R ² = 0,142, P = 0,003; Дополнительный рисунок S2 и дополнительная таблица S5).

Рисунок 3. Бактериальные сообщества в различных ризокомпартментах (ризоплане, ризосфере и массе) растений клевера и кукурузы. Графики анализа главных координат (PCoAs) расстояния Брея – Кертиса на основе OTU между всеми образцами. Дисперсия, объясняемая каждой осью ПК, указана в скобках.

Рисунок 4. Бактериальные сообщества в различных ризокомпартментах (ризоплане, ризосфере и массе) растений клевера и кукурузы в ответ на уровни фосфора в субстрате. (A) Клевер ризоплан; (B) ризосфера клевера; (C) клеверная масса; (D) ризоплан кукурузы; (E) ризосфера кукурузы; и (F) кукуруза навалом. Графики анализа главных координат (PCoAs) расстояния Брея – Кертиса на основе OTU между всеми образцами. Дисперсия, объясняемая каждой осью ПК, указана в скобках.P5 и P30 представляли собой субстрат P удобрений с 5 и 30 мг P и кг ^{— 1} почвы.

Таксономическая характеристика бактериальных сообществ в различных ризокомпартментах

Ризокомпартменты следовали четкой иерархической фильтрации. Мы наблюдали узкоспециализированные бактериальные сообщества ризопланов, характеризующиеся меньшим количеством ОТЕ, встречающихся с высокой относительной численностью.

Proteobacteria были значительно обогащены ризопланом обоих растений (кукуруза: 72.3%; клевер: 61,2%) и ризосфера (кукуруза: 56,1%; клевер: 48,9%). Bacteroidetes также были обогащены в ризосфере. Напротив, другие типы, включая Actinobacteria , Acidobacteria , Chloroflexi , Gemmatimonadetes , были истощены в ризосфере и ризоплане (дополнительный рисунок S3).

Чтобы идентифицировать индикаторные OTU в ризоплане и ризосфере, мы использовали линейный модельный анализ для определения обогащенных бактериальных OTU (рис. 5A, B).У кукурузы 284 и 236 OTU были значительно обогащены ризопланом и ризосферой по сравнению с массивной почвой (рис. 5C), в то время как 84 OTU были почти исключительно приурочены к ризоплану, с их относительной численностью 46,5, 0,4 и 0,2% в почве. ризоплан, ризосфера и насыпной грунт (рис. 5E). По сравнению с насыпной почвой 135 и 103 OTU были значительно обогащены ризопланом и ризосферой клевера (рис. 5D). 59 OTU были почти исключительно приурочены к ризоплану, их относительная численность составляла 50.0, 0,6 и 0,3% в ризоплане, ризосфере и насыпной почве (рис. 5E).

Рис. 5. Обогащение оперативной таксономической единицы в ризоплане корней кукурузы и клевера. На тройном графике изображены ризокомпартменты (ризоплан, ризосфера и насыпная почва). Относительная численность всех OTU (> 0,05%) по крайней мере в одном образце у кукурузы (A) или клевера (B) ( n = 72). Каждая точка соответствует OTU. Размер каждого круга представляет его относительную численность, а положение каждого круга — это вклад OTU в указанном отсеке в общую относительную численность.Оранжевыми и зелеными кружками обозначены ОТЕ, обогащенные ризопланой, ризосферой, тогда как серыми кружками обозначены ОТЕ, которые существенно не обогащены. Диаграмма Венна, сравнивающая дифференциально обогащенные OTU в ризосфере относительно основной почвы и ризоплане относительно ризосферы у растений кукурузы (C) и клевера (D) . Число в перекрывающейся части кругов обозначает последовательные ОТЕ от ризосферы до ризоплана. (E) Относительная численность последовательных обогащенных ОТЕ составляет ризоплан, ризосферу и массу почвы соответственно.

Таксономический анализ показал, что обогащенные OTU в ризоплане в основном принадлежали Proteobacteria с относительной численностью 48,9 и 28,6% в ризоплане клевера и кукурузы (дополнительный рисунок S4A). Другие обогащенные OTU, принадлежащие Actinobacteria , Bacteroidetes , Chloroflexi и Verrucomicrobia , также были сильно обогащены кукурузой, но меньше — клевером (дополнительный рисунок S4A). На уровне класса преобладающими таксонами были α-, β- и γ- Proteobacteria , а относительная численность α- и γ- Proteobacteria была значительно выше у клевера, чем у кукурузы.Относительная численность Actinobacteria , Cytophagia и Verrucomicrobia была значительно ниже у кукурузы, чем у клевера. OTU, связанные с Sphingobacteria , Chloroflexi и Thermomicrobia , были уникальными для ризоплана кукурузы (дополнительный рисунок S4B). На уровне порядка Pseudomonadales , Corynebacteriales , Micrococcales , Rickettsiales и Sphingobacteriales были уникально обнаружены в ризоплане кукурузы (дополнительный рисунок S4C).

Функциональное профилирование микробиоты ризоплана

Чтобы получить более полное представление о возможном функционировании микробиомов ризопланы, были оценены функциональные гены уровня 3 иерархии последовательностей пути KEGG (включая четыре гена, относящиеся к углеродному метаболизму (рисунки 6A, B) и распространенность ортологии KEGG (KO), включая 14 генов). относящиеся к метаболизму фосфора (Рисунки 7А, В). Прогнозируемые функциональные профили в ответ на поступление фосфора кукурузы и клевера заметно различались.Пути, связанные с метаболизмом углерода и фиксацией углерода, значительно различались между P ₃₀ и P ₅ , но эффект был значительным только для кукурузы (Рисунки 6A, B). Гены, такие как АТФ-белок глицерин-3-фосфатной транспортной системы, неорганический переносчик фосфатов (Pit), утилизация полифосфатов (ppk) и экзополифосфатаза, были выше при P ₅ , чем при P ₃₀ . Напротив, количество функциональных генов, относящихся к метаболизму фосфора и цикличности, значительно различается у клевера (рис. 7В), но не у растений кукурузы (рис. 7А).Гены сенсорной гистидинкиназы фосфатного регулона (Pho R), щелочной фосфатазы (Pho A), АТФ-связывающего белка системы транспорта фосфонатов и белка, связывающего систему транспорта фосфата, были выше при P ₃₀ , чем при P ₅ (рис. 7A). . У кукурузы не наблюдалось значительной разницы между двумя уровнями P, за исключением того, что гистидинкиназа, сенсор фосфатного регулона (Pho R) была выше при P ₃₀ , чем при P ₅ (фигура 7B).

Рисунок 6. Статистическое сравнение (критерий Стьюдента t ) между предсказанными функциями в бактериальных OTU ризопланы кукурузы (A) и клевера (B) , выращенного на P ₅ по сравнению с P ₃₀ . OTU, относящиеся к углеродному метаболизму, были основаны на базе данных уровня 3 KEGG с использованием поправки Бенджамини – Хохберга P ( P <0,05).

Рисунок 7. Статистическое сравнение (критерий Стьюдента t ) между предсказанными функциями кукурузы (A) и клевера (B) , выращенного при P ₅ vs.P ₃₀ в бактериальных OTU ризопланы, релевантных для метаболизма P, на основе базы данных о численности KO с использованием коррекции значений Benjamini – Hochberg P ( P <0,05).

Микробные сети в отсеках ризоплана

P (P ₅ по сравнению с P ₃₀ ) изменила бактериальные сообщества у обоих видов растений (рис. 4 и дополнительная таблица S3), что указывает на то, что поступление ресурсов также влияет на бактериальную совокупность в ризокомпартменте. Точно так же удобрение P было основным фактором для сообществ бактерий в промежуточных посевах твердой пшеницы и фасоли (Tang et al., 2016). Как форма, так и количество минеральных удобрений влияют на разнообразие, структуру и функционирование микробных сообществ почвы на поле (Van der Bom et al., 2018). В нашем исследовании важность поступления фосфора в пополнение микробиоты ризосферы была выше для клевера, чем для кукурузы (дополнительная таблица S3), так как рост клевера был значительно подавлен при обработке стерилизованным I ₀ . Изменение микробиоты ризосферы имеет тенденцию приводить к потенциальной функциональной дифференциации с точки зрения приобретения фосфора, и эта гипотеза «крика о помощи» показана для растений при встрече с патогенами (Berendsen et al., 2012; Kwak et al., 2018; Yuan et al. al., 2018). Интересно, что наше функциональное предсказание обогащенных бактериальных таксонов в ризоплане клевера и кукурузы показало значительные различия с точки зрения функциональных генов, имеющих отношение к метаболизму P (рисунки 6A, B) и циклическому циклу C (рисунки 7A, B) у кукурузы и клевера, соответственно. Функциональные гены, связанные с циклом C, значительно различались между P ₅ и P ₃₀ у кукурузы (Рисунки 6A, B), в то время как различия в функциональных генах, связанных с метаболизмом P, наблюдались у клевера (Рисунки 7A, B).Атмосферная фиксация N ₂ клевером, которая требует энергии и, следовательно, фосфора, вероятно, связана с этой разницей. N ₂ -фиксирующие бобовые культуры проявляли высокую активность корневой фосфатазы, особенно при низкой доступности фосфора в почве (Png et al., 2017). Кукуруза является растением с C ₄ , и при низком содержании углерода P в почве может ограничиваться пополнение почвенного микробиома. О важности метаболизма C в микробной сборке ризосферы сообщалось для сахарного тростника (Hamonts et al., 2018). Метагеномный анализ огурца и пшеницы выявил основной набор функциональных генов, включая функциональный профиль генов C и ассимиляцию нитратов (Ofek et al., 2014). Кроме того, бактериальные взаимодействия могут также влиять на сборку микробов в ризосфере кукурузы (Niu et al., 2017). Как микробы взаимодействуют, чтобы повлиять на усвоение фосфора растениями-хозяевами, требует дальнейшего изучения.

Необходимость повышения эффективности использования P-удобрений может привести к использованию микроорганизмов для поддержки цикла P в агроэкосистемах.Отрицательное микробное наследие наблюдалось только у монокультурной кукурузы, но не у клевера. Иерархическая фильтрация бактериальных сообществ в среде обитания наблюдалась в ризоплане двух видов растений, и ризокомпартмент был основным фильтром, определяющим разнообразие и структуру бактериальных сообществ. Конкретные OTU последовательно обогащались от основной массы почвы до ризоплана, и эти доминирующие OTU в ризоплане в совокупности проявляли различные функции в отношении P-метаболизма клевера и C-метаболизма кукурузы.Наши результаты показали, что эффект микробного наследия при долгосрочном оплодотворении P перекрывается идентичностью хозяина и ризокомпартментом. Эти результаты подчеркивают важность диверсификации сельскохозяйственных культур для повышения эффективности фосфора. Тесная связь между микробиомом ризоплана и метаболизмом растения-хозяина указывает на то, что функции микробных сообществ должны быть интегрированы в управление P для повышения эффективности использования P и устойчивого производства продуктов питания.

Наборы данных, созданные или проанализированные в ходе текущего исследования, доступны в репозитории NCBI SRA под идентификатором BioProject: langming (инвентарный номер SRP139180).

Авторские взносы

JZ и ML. ML и SB внесли свой вклад в анализ данных биоинформатики. Все авторы внесли свой вклад в интерпретацию данных и подготовку рукописи, критически рассмотрели и отредактировали рукопись и одобрили ее для публикации.

Финансирование

Эта работа была поддержана Национальной программой ключевых исследований и разработок Китая (2017YFD0200200 и 2017YFD0200202), Национальным фондом естественных наук Китая (31872182) и фондами фундаментальных исследований для центральных университетов (XDJK2019C065).

Конфликт интересов

Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

Благодарности

Мы благодарны доктору Чао Вангу за отбор проб и профессору доктору Филу Мюррею за ценные комментарии во время подготовки рукописи. Мы также благодарны рецензентам за их очень полезные комментарии и предложения по более ранней версии рукописи.

Дополнительные материалы

Дополнительные материалы к этой статье можно найти в Интернете по адресу: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2019.02856/full#supplementary-material

Сноски

Список литературы

Андерсон, М. Дж. (2001). Новый метод непараметрического многомерного дисперсионного анализа. Aust. J. Ecol. 26, 32–46. DOI: 10.1111 / j.1442-9993.2001.tb00081.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Барка, Е.A., Vatsa, P., Sanchez, L., Gaveau-Vaillant, N., Jacquard, C., Klenk, H.P., et al. (2016). Таксономия, физиология и натуральные продукты актинобактерий. Microbiol. Мол. Биол. Rev. 80, 31–43. DOI: 10.1128 / MMBR.00019-15

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Барберан А., Бейтс С. Т., Казамайор Э. О. и Фирер Н. (2012). Использование сетевого анализа для изучения моделей совместной встречаемости в микробных сообществах почвы. ISME J. 6, 343–351.DOI: 10.1038 / ismej.2011.119

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Bastian, M., Heymann, S., and Jacomy, M. (2009). «Gephi: программное обеспечение с открытым исходным кодом для исследования и управления сетями», в материалах Proceedings of the International AAAI Conference on Weblogs and Social Media , (Сан-Хосе, Калифорния).

Google Scholar

Беккерс, Б., Михил, О. Д. Б., Вайенс, Н., Бурджан, В., и Вангронсвельд, Дж. (2017). Структурная изменчивость и дифференциация ниш в ризосферном и эндосферном бактериальном микробиоме полевых деревьев тополя. Microbiome 5, 25–43. DOI: 10.1186 / s40168-017-0241-2

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бенджамини Ю. и Хохберг Ю. (1995). Контроль ложного обнаружения — практичный и мощный подход к множественному тестированию. J. R. Stat. Soc. Сер. B Стат. Метод. 57, 289–300. DOI: 10.1111 / j.2517-6161.1995.tb02031.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Берендсен, Р. Л., Питерс, К. М. Дж., И Баккер, П.А. Х. М. (2012). Микробиом ризосферы и здоровье растений. Trends Plant Sci. 17, 478–486. DOI: 10.1016 / j.tplants.2012.04.001

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Cardman, Z., Arnosti, C., Durbin, A., Ziervogel, K., Cox, C., Steen, A. D., et al. (2014). Verrucomicrobia — кандидаты в бактериопланктон, разлагающий полисахариды, в арктическом фьорде на Шпицбергене. Заявл. Environ. Microbiol. 80, 3749–3756. DOI: 10.1128 / AEM.00899-14

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Кастрильо, Г., Teixeira, R.J.P.J., Paredes, S.H., Law, T.F., De Lorenzo, L., Feltcher, M.E., et al. (2017). Микробиота корней способствует прямой интеграции фосфатного стресса и иммунитета. Природа 543, 513–518. DOI: 10.1038 / nature21417

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чен, Ю., Сун, Р., Сун, Т., Лян, Ю., Цзян, Ю., и Сун, Б. (2018). Органические добавки изменяют коррелированную с фосфором структуру микробов в сети ризосферы арахиса во время долгосрочных режимов удобрения. Заявл. Soil Ecol. 124, 229–239. DOI: 10.1016 / j.apsoil.2017.11.023

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Кондрон, Л. М., Спирс, Б. М., Хейгарт, П. М., Тернер, Б. Л., и Ричардсон, А. Е. (2013). Роль унаследованного фосфора в повышении эффективности использования фосфора в мире. Environ. Dev. 8, 147–148. DOI: 10.1016 / j.envdev.2013.09.003

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Де Фрис, Ф. Т., и Валленштейн, М. Д. (2017). Подземные связи, лежащие в основе надземного производства продуктов питания: основа для оптимизации экологических связей в ризосфере. J. Ecol. 105, 913–920. DOI: 10.1111 / 1365-2745.12783

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Динеш Р., Чаудхури С. Г., Шиджа Т. Э. и Шива К. Н. (2006). Микробная активность и биомасса почвы стимулируются бобовыми покровными культурами. J. Plant Nutr. Почвоведение. 172, 288–296. DOI: 10.1002 / jpln.200700300

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Дюран-Пинедо, А.Э., Пастер, Б., Телес, Р., и Фриас-Лопес, Дж. (2011). Корреляционный сетевой анализ применяется к сложным биопленочным сообществам. PLoS One 6: e28438. DOI: 10.1371 / journal.pone.0028438

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Dombrowski, N., Schlaeppi, K., Agler, M. T., Hacquard, S., Kemen, E., Garrido-Oter, R., et al. (2017). Динамика корневой микробиоты многолетнего растения Arabis alpina зависит от времени пребывания в почве, но не зависит от времени цветения. ISME J. 11, 43–55. DOI: 10.1038 / ismej.2016.109

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Эдвардс, Дж., Джонсон, К., Сантос-Медельин, К., Лурье, Э., Подишетти, Н. К., Бхатнагар, С. и др. (2015). Структура, вариация и сборка корневых микробиомов риса. Proc. Natl. Акад. Sci. США 112, 911–920. DOI: 10.1073 / pnas.14145

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Fang, Y., Du, Y., Wang, J., Wu, A., Qiao, S., Xu, B., et al. (2017). Умеренный стресс засухи влияет на рост корней и урожайность старых, современных и недавно выпущенных сортов озимой пшеницы. Фронт. Plant Sci. 8: 672. DOI: 10.3389 / fpls.2017.00672

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Фауст К., Сатирапонгсасути Дж. Ф., Изард Дж., Сегата Н., Геверс Д., Раес Дж. И др. (2012). Отношения микробного сосуществования в микробиоме человека. PLoS Comput. Биол. 8: e1002606. DOI: 10.1371 / journal.pcbi.1002606

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Hammer, Ø, Харпер, Д. А.Т. и Райан П. Д. (2001). Прошлое: программный пакет палеонтологической статистики для обучения и анализа данных. Palaeontol. Электрон. 4, 65–78.

Google Scholar

Хамонц, К., Триведи, П., Гриньер, Дж., Холфорд, П., Дриго, Б., Андерсон, И. А. и др. (2018). Синдром желтого полога сахарного тростника связан со сдвигами в метагеноме почвы ризосферы, но не с общей микробной функцией почвы. Soil Biol. Biochem. 125, 275–285. DOI: 10.1016 / j.почваbio.2018.07.019

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хартман, К., ван дер Хейден, М. Г., Руссели-Провент, В., Вальзер, Дж. К., и Шлаеппи, К. (2017). Расшифровка состава и функции корневого микробиома бобового растения. Микробиом 5, 2–13. DOI: 10.1186 / s40168-016-0220-z

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Hashizume, H., Hirosawa, S., Sawa, R., Muraoka, Y., Ikeda, D., Naganawa, H., et al. (2004).Трипропептины, новые противомикробные агенты, производимые Lysobacter sp. J. Antibiot 57, 52–58. DOI: 10.7164 / антибиотики.57.52

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ху, Ю., Вересоглоу, С. Д., Тедерсоо, Л., Сюй, Т., Ге, Т., Лю, Л. и др. (2019). Противопоставление широтного разнообразия и моделей совместного присутствия почвенных грибов и растений в лесных экосистемах. Soil Biol. Biochem. 131, 100–110. DOI: 10.1016 / j.soilbio.2019.01.001

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Квак, М. Дж., Конг, Х. Г., Чой, К., Квон, С. К., Сон, Дж. Й., Ли, Дж. И др. (2018). Структура микробиома ризосферы изменяется, чтобы обеспечить устойчивость томатов к увяданию. Нат. Biotechnol. 36, 1100–1109. DOI: 10.1038 / nbt1118-1117

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лангиль, М. Г. И., Заневельд, Дж., Капорасо, Дж. Дж., Макдональд, Д., Найтс, Д., Рейес, Дж. А. и др. (2013). Прогнозирующее функциональное профилирование микробных сообществ с использованием последовательностей маркерного гена 16S рРНК. Нат. Biotechnol. 31, 814–821. DOI: 10.1038 / NBT.2676

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли, X., Руи, Дж., Мао, Ю., Яннарелл, А., и Маки, Р. (2014). Динамика структуры бактериального сообщества в ризосфере сорта кукурузы. Soil Biol. Biochem. 68, 392–401. DOI: 10.1016 / j.soilbio.2013.10.017

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лундберг, Д. С., Лебейс, С. Л., Паредес, С. Х., Юрстон, С., Геринг, Дж., И Малфатти, С. (2012). Определение основного микробиома корней Arabidopsis thaliana. Природа 488, 86–90. DOI: 10.1038 / nature11237

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Мандер, К., Вакелин, С., Янг, С., Кондрон, Л., и О’Каллаган, М. (2012). Распространенность и разнообразие фосфатсолюбилизирующих бактерий связаны со статусом фосфора в почвах пастбищ. Soil Biol. Biochem. 44, 93–101. DOI: 10.1016 / j.soilbio.2011.09.009

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Мендес, Л. В., Курамаэ, Э. Э., Наваррет, А. А., Ван Вин, Дж. А., и Цай, С. М. (2014). Таксономический и функциональный отбор микробного сообщества в ризосфере сои. ISME J. 8, 1577–1587. DOI: 10.1038 / ismej.2014.17

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Менезес-Блэкберн, Д., Джайлз, К., Дарч, Т., Джордж, Т. С., Блэквелл, М., Заик, М. и др. (2018). Возможности мобилизации стойкого фосфора из сельскохозяйственных почв: обзор. Растительная почва 427, 5–16. DOI: 10.1007 / s11104-017-3362-2

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Мейер Д., Цейлис А. и Хорник К. (2015). vcd: визуализация категориальных данных. Пакет R версии 1.0.

Google Scholar

Миранда-Санчес, Ф., Ривера, Дж., И Винуэса, П. (2016). Структура разнообразия сообществ Rhizobiaceae, населяющих почвы, поверхности корней и клубеньки, свидетельствует о сильном отборе ризобиальных партнеров бобовыми культурами. Environ. Microbiol. 18, 2375–2391. DOI: 10.1111 / 1462-2920.13061

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Морроу, К. М., Борн, Д. Г., Хамфри, К., Ботте, Э. С., Лаффи, П., Заневельд, Дж. И др. (2015). Естественный вулканический CO ₂ просачиваний показывают будущие траектории для ассоциаций хозяев и микробов в кораллах и губках. ISME J. 9, 894–908. DOI: 10.1038 / ismej.2014.188

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ню, Б., Полсон, Дж. Н., Чжэн, X., и Колтер, Р. (2017). Упрощенное и репрезентативное бактериальное сообщество корней кукурузы. Proc. Natl. Акад. Sci. США 114, 2450–2459. DOI: 10.1073 / pnas.1616148114

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ocimati, W., Tusiime, G., Opio, F., Ugen, M.A., and Buruchara, R. (2017). Сорго (Sorghum bicolor) в качестве промежуточной культуры или севооборота фасоли способствует выживанию возбудителей корневой гнили фасоли и увековечиванию корневой гнили фасоли. Plant Pathol. 66, 1580–1586. DOI: 10.1111 / ppa.12699

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Офек М., Воронов-Гольдман М., Хадар Ю., Минц Д. (2014). Влияние сигнатуры хозяина на микробиомы, связанные с корнями растений, выявлено путем анализа местных и активных сообществ. Environ. Microbiol. 16, 2157–2167. DOI: 10.1111 / 1462-2920.12228

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Оксанен, Дж., Бланше, Ф.Г., Киндт, Р., Лежандр, П., Минчин, П. Р., и О’Хара, Р. Б. (2013). Vegan, Пакет анализа сообщества. Пакет R версии 2.2-0.

Google Scholar

Паради Э., Клод Дж. И Стриммер К. (2004). APE: анализ филогенетики и эволюции на языке R. Биоинформатика 20, 289–290.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Паркс, Д. Х., Бейко, Р. Г. (2010). Выявление биологически значимых различий между метагеномными сообществами. Биоинформатика 26, 715–721. DOI: 10.1093 / биоинформатика / btq041

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пайффер, Дж. А., Спор, А., Корен, О., Джин, З., Триндж, С. Г., Дангл, Дж. Л. и др. (2013). Разнообразие и наследуемость микробиома ризосферы кукурузы в полевых условиях. Proc. Natl. Акад. Sci. США 110, 6548–6553. DOI: 10.1073 / pnas.1302837110

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Перес-Харамильо, Дж.Э., де Холландер, М., Рамирес, К. А., Мендес, Р., Рааймейкерс, Дж. М., и Каррион, В. Дж. (2019). Расшифровка сборки микробиома ризосферы дикой и современной фасоли ( Phaseolus vulgaris ) в естественных и сельскохозяйственных почвах Колумбии. Microbiome 7, 114–130. DOI: 10.1186 / s40168-019-0727-1

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Png, Г. К., Тернер, Б. Л., Альборнос, Ф. Э., Хейс, П. Э., Ламберс, Х., Лалиберте, Э. (2017).Повышенная активность корневой фосфатазы у азотфиксирующих ризобий, но не у актиноризных растений, при снижении доступности фосфора. J. Ecol. 105, 1246–1255. DOI: 10.1111 / 1365-2745.12758

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Райнхольд-Хурек, Б., Бюнгер, В., Бурбано, К. С., Сабале, М., и Хурек, Т. (2015). Корни, формирующие их микробиом: глобальные очаги микробной активности. Ann. Rev. Phytopathol. 53, 403–424. DOI: 10.1146 / annurev-phyto-082712-102342

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ревиллини, Д., Геринг, К.А., и Джонсон, Н.С. (2016). Роль адаптированных к местным условиям микориз и ризобактерий в системах обратной связи растение-почва. Функц. Ecol. 30, 1086–1098. DOI: 10.1111 / 1365-2435.12668

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Саттари, С. З., Бауман, А. Ф., Гиллер, К. Э., и Ван Иттерсум, М. К. (2012). Остаточный почвенный фосфор как недостающий элемент в головоломке глобального фосфорного кризиса. Proc. Natl. Акад. Sci. США 109, 6348–6353. DOI: 10.1073 / пнас.1113675109

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Северин, П., Ван, Л. Б., Кьельдгаард, М., Руссо, К. Дж., Пассмор, Л. А., Хов-Йенсен, Б. и др. (2015). Структурные представления о машине бактериальной лиазы углерода фосфор. Природа 525, 68–72. DOI: 10.1038 / природа14683

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Силва, США, Медейрос, Дж. Д., Лейте, Л. Р., Мораис, Д. К., Куадрос-Орельяна, С., Oliveira, C.A., et al. (2017). Длительное внесение минеральных фосфатов влияет на микробные сообщества ризосферы кукурузы. Фронт. Microbiol. 8: 1266. DOI: 10.3389 / fmicb.2017.01266

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Су, Дж., Дин, Л., Сюэ, К., Яо, Х., Квенсен, Дж., Бай, С. и др. (2015). Долгосрочное сбалансированное удобрение увеличивает функциональное разнообразие почвенных микробов в рисовой почве с ограниченным содержанием фосфора. Мол. Ecol. 24, 136–150.DOI: 10.1111 / mec.13010

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Табатабай М.А. (1994). «Почва, ферменты», Методы анализа почв, часть 2. Микробиологические и биохимические свойства. СССА Книжная серия № 5 , изд. Дж. М. Бигхэм, (Мэдисон, Висконсин: SSSA), 775–834.

Google Scholar

Тан, X., Пласелла, С. А., Дайде, Ф., Бернар, Л., Робин, А., Журне, Э. П. и др. (2016). Доступность фосфора и микробное сообщество в ризосфере посевов зерновых и бобовых культур по градиенту P-удобрений. Почва растений 407, 119–134. DOI: 10.1007 / s11104-016-2949-3

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Вэнс, К. П., Удэ-Стоун, К., и Аллан, Д. Л. (2003). Приобретение и использование фосфора: критические адаптации растений для обеспечения невозобновляемых ресурсов. New Phytol. 157, 423–427. DOI: 10.1046 / j.1469-8137.2003.00695.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван дер Бом, Ф., Нуньес, И., Раймонд, Н. С., Хансен, В., Бонничсен, Л., Magid, J., et al. (2018). Форма, уровень и продолжительность длительного удобрения влияют на разнообразие, структуру и функционирование микробных сообществ почвы в поле. Soil Biol. Biochem. 122, 91–103. DOI: 10.1016 / j.soilbio.2018.04.003

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван дер Хейден, М. Г. А., Де Брюин, С., Лакерхофф, Л., Ван Логтестейн, Р. С. П., и Шлаеппи, К. (2016). Широко распространенный симбиоз растений, грибов и бактерий способствует биоразнообразию растений, питанию растений и пополнению рассады. ISME J. 10, 389–399. DOI: 10.1038 / ismej.2015.120

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван дер Хейден, М.Г.А., и Шлаэппи, К. (2015). Поверхность корня как рубеж для исследования микробиома растений. Proc. Natl. Акад. Sci. США 112, 2299–2300. DOI: 10.1073 / pnas.1500709112

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван дер Путтен, В. Х., Барджетт, Р. Д., Бевер, Дж. Д., Беземер, Т. М., Каспер, Б.Б., Фуками Т. и др. (2013). Обратная связь между растениями и почвой: прошлое, настоящее и будущее. J. Ecol. 101, 265–276. DOI: 10.1111 / 1365-2745.12054

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Wei, Z., Gu, Y., Friman, V.P., Kowalchuk, G.A., Xu, Y., Shen, Q., et al. (2019). Первоначальный состав и функционирование микробиома почвы предопределяют здоровье растений в будущем. Sci. Adv. 5: eaaw0759. DOI: 10.1126 / sciadv.aaw0759

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сяо, X., Chen, W., Zong, L., Yang, J., Jiao, S., Lin, Y., et al. (2017). Два культивируемых бобовых растения демонстрируют процесс обогащения микробиома в ризокомпартментах. Мол. Ecol. 26, 1641–1651. DOI: 10.1111 / mec.14027

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ян, Ю., Ван, Н., Го, X., Чжан, Ю., и Е, Б. (2017). Сравнительный анализ структуры бактериального сообщества в ризосфере кукурузы методом высокопроизводительного пиросеквенирования. PLoS One 12: e0178425.DOI: 10.1371 / journal.pone.0178425

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Йилмаз П., Парфри Л. В., Ярза П., Геркен Дж., Прюсс Э., Кваст К. и др. (2014). Таксономические рамки SILVA и «проекта живого дерева всех видов (LTP)». Nucleic Acids Res. 42, 643–648. DOI: 10.1093 / nar / gkt120

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Юань, Дж., Чжао, Дж., Вэнь, Т., Чжао, М., Ли, Р., Гуссенс, П., и др.(2018). Экссудаты корней являются причиной распространения наземных патогенных инфекций, передаваемых через почву. Microbiome 6, 156–168. DOI: 10.1186 / s40168-018-0537-x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Згадзай Р., Гарридо-Отер Р., Йенсен Д. Б., Копривова А., Шульце-Леферт П. и Радутою С. (2016). Симбиоз корневых клубеньков в лотосе Lotus japonicus способствует формированию отличительных ризосферных, корневых и клубеньковых бактериальных сообществ. Proc.Natl. Акад. Sci. США 113, 7996–8005. DOI: 10.1073 / pnas.1616564113

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чжоу, Ю., Чжу, Х., Фу, С., и Яо, К. (2017). Различия в структуре микробного сообщества почвы, связанного с разными видами бобовых, больше, чем с разными видами трав. Фронт. Microbiol. 8: 1007. DOI: 10.3389 / fmicb.2017.01007

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чжу, Дж., Ли, М., и Уилан, М. (2018). Активаторы фосфора способствуют доступности устаревшего фосфора в сельскохозяйственных почвах: обзор. Sci. Total Environ. 612, 522–537. DOI: 10.1016 / j.scitotenv.2017.08.095

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar